Caracterización epidemio-molecular de la infección por Clostridioides difficile en pacientes hospitalizados con cuadro diarreico en instituciones de salud. 2019

La infección por Clostridioides difficile es una de las principales causas de diarrea nosocomial en hospitales del mundo, asociada a antibióticos de amplio espectro. Estudio descriptivo, retrospectivo, de corte transverso, de tipo censal. Se estudiaron 281 muestras de pacientes hospitalizados con la infección, se analizaron características socio-demográficas, clínicas y se caracterizó molecularmente al patógeno. Como resultado, se obtuvieron pacientes con la infección con una mediana de edad de 64 años siendo el 61,5 % del sexo masculino. El promedio de presentación del cuadro diarreico fue de 5 días, con tratamiento antimicrobiano de 8 días e internación de 15 días. El 94% tuvo tratamiento antimicrobiano previo, y el 6% estuvo expuesto a algún factor de riesgo. Los antimicrobianos más utilizados solos o en combinación fueron betalactámicos, fluoroquinolonas, vancomicina y carbapenémicos. Las áreas de internación con mayor frecuencia de presentación de la infección fueron las unidades de Clínica Médica, Traumatología, Geriatría y Unidad de Terapia Intensiva. La prevalencia de C. difficile toxigénico fue de 14%, y de esta frecuencia el 100% presentó toxinas TcdA y TcdB, con ausencia de toxinas binarias y deleción del gen tcdC. Se constató la presencia grupos clonales en la misma unidad de internación y misma institución de salud. El 100% de las cepas resultaron susceptibles a los antibióticos de elección para la infección. La prevalencia de la infección y presencia de perfiles clonales detectadas revelan la necesidad de un mejoramiento en el sistema de control de infecciones, así como del fortalecimiento y vigilancia de la resistencia antimicrobiana.

Clostridioides difficile infection is one of the main causes of nosocomial diarrhea in hospitals worldwide, associated with broad-spectrum antibiotics. Descriptive, retrospective, cross-sectional, census-type study. Two hundred eighty-one samples from patients hospitalized with the infection were studied, sociodemographic and clinical characteristics were analyzed and the pathogen was characterized molecularly. As a result, patients with the infection had a median age of 64 years and 61.5% male. The average presentation of diarrhea was 5 days, antimicrobial treatment 8 days and hospitalization 15 days. Ninety four percent had previous antimicrobial treatment, and 6% were exposed to some risk factor. The most commonly used antimicrobials alone or in combination were beta-lactams, fluoroquinolones, vancomycin, and carbapenems. The hospitalization areas with the highest frequency of presentation of the infection were the Clinical Medicine, Traumatology, Geriatrics and Intensive Care Unit units. The prevalence of toxigenic C. difficile was 14%, and of this frequency, 100% presented TcdA and TcdB toxins, with the absence of binary toxins and deletion of the tcdC gene. The presence of clonal groups was verified in the same hospitalization unit and the same health institution. All the strains were susceptible to the antibiotics of choice for the infection. The prevalence of infection and the presence of clonal profiles detected reveal the need for improvement of the infection control system, as well as of the strengthening and surveillance of antimicrobial resistance.

Resistencia antimicrobiana en Escherichia coli de muestras cecales de bovinos para carne faenados en frigoríficos de la zona del arroyo Mburicao, Asunción-Paraguay. Año 2021

La resistencia a los antimicrobianos es una de las preocupaciones más importantes a nivel mundial, ya que determina un aumento de la morbimortalidad de los pacientes y el incremento de los costos de la atención de salud; problema cuyo abordaje debe ser realizado bajo el enfoque de Una Salud. El objetivo principal de este trabajo fue evaluar la resistencia antimicrobiana en Escherichia coli provenientes de muestras cecales de bovinos de carne faenados en frigoríficos de la zona del Arroyo Mburicao, Asunción-Paraguay, de setiembre a noviembre de 2021. Fueron colectadas 181 muestras de ganados provenientes de la Región Oriental y Occidental, y cultivadas en agar cromogénico suplementados con ciprofloxacina, colistina, cefotaxima y meropenem. Las colonias aisladas fueron identificadas, genotipificadas (PCR convencional) y sometidas a pruebas de susceptibilidad. El principal hallazgo fue la confirmación de la resistencia a las fluoroquinolonas en un 8,3% debida a la portación de los genes Qnr S, Qnr B y aac-6´-Ib-cr, involucrados en el mecanismo plasmídico de resistencia a quinolonas. Además, la resistencia acompañante encontrada en los aislamientos resistentes del 100% a tetraciclina y 53% a trimetoprim/sulfametoxazol. No se encontraron aislamientos con resistencia a cefotaxima, colistina y meropenem. Los resultados obtenidos son de suma relevancia para la generacion de conocimiento sobre los perfiles de resistencia de microorganismos en el sector veterinario, pudiendo contribuir a la elaboración de guías nacionales para el uso prudente de antimicrobianos y apoyando al trabajo multisectorial en la lucha para la contención de la resistencia antimicrobiana.

Antimicrobial resistance is one of the most critical concerns worldwide since it determines an increase in patient morbidity and mortality and the increase in healthcare costs, a problem whose approach must be carried out under the One Health approach. The main objective of this work was to evaluate antimicrobial resistance in Escherichia coli from cecal samples of cattle for meat slaughtered in meat processing plants in the Arroyo Mburicao area, Asunción-Paraguay, from September to November 2021. One hundred eighty one samples of cattle from the Eastern and Western Region were collected, and cultured on chromogenic agar supplemented with ciprofloxacin, colistin, cefotaxime, and meropenem. Isolated colonies were identified, genotyped (conventional PCR) and subjected to susceptibility tests. The main finding was the confirmation of resistance to fluoroquinolones in 8.3% due to the carrying of genes Qnr S, Qnr B and aac-6'-Ib-cr, involved in the plasmid mechanism of resistance to quinolones. In addition, the accompanying resistance found in the isolates was 100% resistant to tetracycline and 53% to trimethoprim/sulfamethoxazole. Isolates with resistance to cefotaxime, colistin and meropenem were not found. The results obtained are highly relevant for the generation of knowledge about the resistance profiles of microorganisms in the veterinary sector. It can contribute to the development of national therapeutic guidelines for the prudent use of antimicrobials, and supporting multisectoral work in the fight to contain antimicrobial resistance.

Primer reporte de Enterobacterales dobles productores de carbapenemasas en hospitales de Paraguay. Año 2021

RESUMEN Las carbapenemasas se encuentran ampliamente distribuidas en nuestro país, tanto en bacilos gramnegativos fermentadores como no fermentadores. Durante 2021, se ha reportado incremento de cepas con estas enzimas. Con el objetivo de evaluar la doble producción de carbapenemasas en Enterobacterales y comunicar su circulación, fue puesta a punto una PCR convencional múltiple. Estudio retrospectivo en 128 aislamientos provenientes de 20 centros colaboradores de la Red Nacional de Vigilancia de la RAM (Capital, Central e interior del país), remitidos al LCSP entre febrero y setiembre de 2021, para confirmación y genotipificación de carbapenemasas. Se realizaron pruebas fenotípicas y colorimétricas con sustratos específicos, y pruebas genotípicas (PCR convencional múltiple) para la detección simultánea de varios genes de resistencia (bla NDM, bla KPC, bla OXA-48-like, bla IMP y bla VIM). De los 128 aislamientos estudiados, 107 correspondieron a Klebsiella pneumoniae, 14 a Enterobacter cloacae complex, entre otros; aislados en mayor frecuencia de muestras de orina (30%), respiratorias (30%), sangre y catéter (24%). Los genes de resistencia a los carbapenemes detectados fueron: bla NDM (77,3%), bla KPC (17,2%); siendo confirmada la doble producción de carbapenemasas en 7 aislamientos (5,5%) provenientes de 4 centros diferentes de la capital de país y uno de Central; 6 de ellas (K. pneumoniae) con bla NDM+bla KPC y 1 (E. cloacae complex) con bla NDM+bla OXA-48-like; confirmando circulación de Enterobacterales dobles productores de carbapenemasas en el país (KPC+NDM y OXA+NDM); hallazgos que obligan a proveer de capacidades de detección, de manera a que se puedan tomar medidas oportunas y eficaces de contención y control.

ABSTRACT Carbapenemases are widely distributed in our country, both in fermenting and non-fermenting gram-negative bacilli. During 2021, an increase in strains with these enzymes has been reported. In order to evaluate the double production of carbapenemases in Enterobacterales and communicate their circulation, a multiple conventional PCR was set up. Retrospective study carried out in 128 isolates from 20 collaborating centers of the National AMR Surveillance Network (Capital, Central and interior of the country), sent to the LCSP between February and September 2021, for confirmation and genotyping of carbapenemases. Phenotypic and colorimetric tests were performed with specific substrates, as well as genotypic tests (multiple conventional PCR) for the simultaneous detection of several resistance genes (blaNDM, blaKPC, blaOXA-48-like, blaIMP and blaVIM). Of the 128 isolates studied, 107 corresponded to Klebsiella pneumoniae, 14 to Enterobacter cloacae complex, among others; isolated in higher frequency from urine (30%), respiratory (30%), blood and catheter (24%) samples. The genes for resistance to carbapenems detected were: blaNDM (77.3%), blaKPC (17.2%); the double production of carbapenemases was confirmed in 7 isolates (5.5%) from 4 different centers in the capital of the country and one in Central; 6 of them (K. pneumoniae) with blaNDM + blaKPC and 1 (E. cloacae complex) with blaNDM + blaOXA-48-like; confirming circulation of double Enterobacterales producers of carbapenemases in the country (KPC + NDM and OXA + NDM); findings that require the provision of detection capabilities, so that timely and effective containment and control measures can be taken.

Dermatofitos: casuística en la Sección de Micología del Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción - Paraguay (2000 - 2016) / Dermatophytes: casuistry in the Mycology Section of the Central Public Health Laboratory, Asunción - Paraguay (2000 - 2016)

Introducción: los dermatofitos son las principales causas de micosis superficial. Su epidemiología es poco conocida en Paraguay. Objetivos: describir las especies prevalentes, tipos de tiñas y características según sexo y edad de pacientes que acudieron al Laboratorio Central de Salud Pública, Asunción- Paraguay,en el período 2000-2016. Materiales y Métodos: se estudiaron pacientes de todas las edades con diagnóstico de micosis superficiales. Las muestras procesadas fueron uñas, pelos y escamas epidérmicas Se realizaron exámenes directos con KOH y cultivos. La identificación fue por macro y microscopía de las colonias. Resultados: de 6.652 pacientes con sospecha de micosis superficiales, 803 (12%) fueron positivas para dermatofitos. Los aislamientos fueron Microsporumcanis (33,9%), Trichophytonrubrum (23,8%), Trichophytonmentagrophytes (22%), Trichophytontonsurans (12,6%), Microsporumgypseum (6,2%), Trichophytonverrucosum (1,4%), un aislamiento para Microsporummanuumy Epidermophytonfloccosum respectivamente. Los tipos de tiñas fueron: capitis (54,3%), corporis (27,1%) yunguium (9,8%), pedís (3,8%), cruris (3%) y manuum (2%). Conclusión: el hongo prevalente fue Microsporumcanis (33,9%) y la tiña más frecuente fue capitis.

Introduction: dermatophytes are the main causes of superficial mycosis. Its epidemiology is less known in Paraguay. Objectives: to describe the prevalent species, types of tinea and features according to sex and age of patients who attended the Central Laboratory of Public Health, Asunción-Paraguay, in the period 2000-2016. Materials and Methods: patients of all ages with a diagnosis of superficial mycosis were studied. The samples processed were nails, hairs and epidermal scales. Direct tests were carried out with KOH and cultures. The identification was by macro scopy and microscopy of the colonies. Results: of 6,652 patients with suspected superficial mycoses, 803 (12%) were positive for dermatophytes. The isolates were Microsporum canis (33.9%), Trichophyton rubrum (23.8%), Trichophyton mentagrophytes (22%), Trichophyton tonsurans (12.6%), Microsporum gypseum (6.2%), Trichophyton verrucosum (1,4%), isolation for Microsporum manuum and Epidermophyton floccosum respectively. The types of tinea were: capitis (54.3%), corporis (27.1%) and unguium (9.8%), pedis (3.8%), cruris (3%) and manuum (2%). Conclusion: The prevalent fungus was Microsporum canis (33.9%) and the most frequent tinea was capitis.